Contenu | Rechercher | Menus

Annonce

Si vous avez des soucis pour rester connecté, déconnectez-vous puis reconnectez-vous depuis ce lien en cochant la case
Me connecter automatiquement lors de mes prochaines visites.

À propos de l'équipe du forum.

#1 Le 19/02/2006, à 16:56

mezhoud

install un paquet.tar.gz et le rendre les applications exécutables

nom prgm est blast.tar.gz. contenant deux applications : blastall et formatdb.

après décompression et dépackatage:

blast.tar.gz --> blast.tar -->  bin data  doc 
et dans le /bin il y a des deux applications blastall et formatdb.

Il a fallu crée des liens avec ces applications et le shell en faisant :

set path= ( ~/bin $path )
ln -s ~/bin/blast/blastall ~/bin
ln -s ~/bin/blast/formatdb ~/bin

et insérer dans .bashrc ça:

set path= ( ~/bin $path )
setenv BLASTMAT = ~/bin/blast/data.

=====> je n'ai pas réussi à créer le lien entre les application et le bash.
question
1- la syntax est elle juste?
2- set commande non reconnue!!


merci

Hors ligne

#2 Le 19/02/2006, à 17:24

mezhoud

Re : install un paquet.tar.gz et le rendre les applications exécutables

solutions: problème de syntax avec le bash qui n'aime pas les espaces et aime les cotes.
insérer dans .bashrc ça:

set path= '( ~/bin $path )'
setenv BLASTMAT = ~/bin/blast/data

et exécuter l'application pas dans /home mes dans /home/bin où se trouve les applications.

Hors ligne