[HowTo] Installation et lancement automatique de FAH pour Ubuntu !

ikki · Le 11/01/2008, à 13:43

fait un

cat /boot/grub/menu.lst

et si tu as une installation classique, tu devrais voir :

title           Ubuntu 7.10, memtest86+
root            (hd0,0)
kernel          /memtest86+.bin
quiet

Cela correspond à l'entrée grub pour memtest

Dernière modification par ikki (Le 11/01/2008, à 13:43)

Ras' · Le 11/01/2008, à 14:33

Mouarf, j'suis vraiment aveugle ^^
Bon ben j'ferais ça au prochain boot

ikki · Le 11/01/2008, à 14:46

Raskal a écrit :

Mouarf, j'suis vraiment aveugle ^^
Bon ben j'ferais ça au prochain boot

ou au prochain freeze

Spirzouf · Le 15/02/2008, à 20:43

ikki a écrit :

Spirzouf a écrit :
Raskal a écrit :
Franchement l'installation est vraiment pas compliquée...
[...]
Après effectivement c'est pour qu'il tourne en fond, pour avoir de joli fioritures comme sous win c'est autre chose...
L'installation du programme ne m'a pas posé problème grace au tuto dans la doc du site.
C'est toutes les modifs qu'il faut faire ensuite pour que le prog ne pompe pas 100% du CPU en permanence...
Pour ce qui est de la représentation 3D du déploiement des protéines dans la version windows, je ne l'utilisais pas.
Par contre sous windows, on écrit 15, et hop, 15% d'utilisation CPU en permanence (mon proc chauffe pas mal...). Simple et efficace !
oui bon effectivement le client Linux ne permet pas de limiter le pourcentage d'occupation du processus mais des alternatives sont possibles
J'ai tourné pendant 3 ans avec mon P4 E 2.8 Ghz Prescott qui chauffait énormément, et il se porte toujours aussi bien, malgré ses 65° de température quasi permanente, et ceci 24h/24

Je viens d'installer wine en vue de tester un peu mes anciens jeux windows, et le 1er truc que j'ai installé, c'est FAH ==> ça tourne bien apparement...

Ras' · Le 15/02/2008, à 21:25

autant utiliser directement le client linux non ?

tu dois avoir de bonnes raisons de préférer le client windows mais bon, c'est tiré par les cheveux...

Dernière modification par Raskal (Le 15/02/2008, à 21:25)

Spirzouf · Le 15/02/2008, à 22:11

bah non, c'est justement à cause du bordel que c'est avec ces scripts pour pouvoir régler le pourcentage d'utilisation du proc... là, au moins c'est simple

C'est peut être boulet, mais au moins j'arrive à le faire fonctionner à 20% si je veux... Parce que vos script, ça me parait bien compliqué et surtout bien expérimental (sans aucune désobligeance)

sylvain1970 · Le 16/02/2008, à 11:23

Bonjour,
ce n'est pas expérimental, çà fonctionne très bien (je ne prends pas mal ta phrase, j'explique seulement ).
par contre, cela utilise le proc à 100% MAIS seulement les ressources non utilisées.
cad que dès que le proc a besoin de ressource pour faire autre chose, l'utilisation du proc par FAH est réduite d'autant.
comme çà, ton proc est toujours à 100% mais disponible si besoin.

Dernière modification par sylvain1970 (Le 16/02/2008, à 11:24)

Spirzouf · Le 16/02/2008, à 11:42

Bonjour !

Oui, le FAH linux marche très bien, je l'avais installé initialement.
Le seul truc, c'est que faire tourner mon proc à 100% en permanence (même si j'ai bien compris que c'était exécuté en priorité basse, laissant le proc libre pour les autres appli) m'embête un peu en raison de la température processeur (en particulier pour l'été à venir).
Donc je parlais des scripts destinés à réduire l'utilisation proc, qui doivent certainement bien marcher mais me semblent un peu délicats à mettre en Å“uvre (me concernant bien sûr).

Dernière modification par Spirzouf (Le 16/02/2008, à 12:14)

sylvain1970 · Le 16/02/2008, à 11:57

Ah, oui, là, ok

NaKroTeK · Le 28/02/2008, à 19:43

Heu une idée pour faire fonctionné f@h avec 2 instances???

Ras' · Le 28/02/2008, à 19:50

2 dossiers différents, et 2 machines ID différents (tu change ça en lançant le client avec -configonly)
Si c'est pour un dualcore je crois qu'il y a quelque chose qui s'apelle smp mais j'en connais pas plus, demande sur le forum de l'alliance francophone :
http://folding.mesdiscussions.net/foldinghome/liste_categorie.htm

sylvain1970 · Le 28/02/2008, à 20:53

Pour info, le smp ne fonctionne que sous linux 64 bits.
Mais il faut laisser l'ordi allumé quasiment 24H/24H pour tenir les deadlines.

_Enchained · Le 12/03/2008, à 11:35

Aux contributeurs de la page http://doc.ubuntu-fr.org/fah :
Je vous suggère de déplacer la page à un nom plus parlant comme : http://doc.ubuntu-fr.org/folding_at_home

Ras' · Le 12/03/2008, à 12:35

En cherchant "folding at home" dans la doc on trouve donc en partant de là... En général les gens qui connaissent 'folding @ home' connaissent l'abréviation f@h, enfin c'est ce que j'en dit ^^

Ras' · Le 29/04/2008, à 10:47

Pour hardy je me suis installé une 64 bits, comme ça je peux utiliser fah en smp (utilisation des deux cores, WU "plus importantes" et raportant plus de points). Pour l'occasion je me suis fait un petit script que j'ai intégré au bureau grâce à un gnome-terminal et à compiz :

Le script se lance au démarrage, demande "on plie aujourd'hui ?" par une fenêtre zenity, si je répond oui fah6 se lance. Les températures et l'avancement sont mis à jours toutes les 2mn, les stats toutes les 2 heures.
Si la température des cores passe au dessus de 80° le script est arreté.

J'ai pas fait un script aussi complet que celui de la doc dans le sens ou y'a pas de fonction stop etcetc, j'ai juste adapté un truc à mes besoins, je le retravaillerais peut être plus tard.
Si y'en à que ça interesse je pourais le poster

sylvain1970 · Le 29/04/2008, à 17:44

Bonjour,
le script m'intéresse.
l'affichage, c'est conky ?, m'intéresse aussi celui-là.

Dernière modification par sylvain1970 (Le 29/04/2008, à 17:44)

Ras' · Le 29/04/2008, à 18:49

je mettrais le script plus tard faut que je modifie un ou deux trucs dedans ^^
L'affichage c'est un gnome terminal intégré au bureau grâce à compiz, on doit pouvoir faire afficher la même chose avec conky, suffit de chercher

Ras' · Le 05/05/2008, à 16:05

Désolé j'suis parti en vacances et du coup j'ai oublié de le poster ^^

Donc voila le script, un peu à l'arrache mais il fait ce que je veux c'est le principal.
je l'ai modifié donc maintenant il n'affiche plus que deux lignes dans "Avancement", et j'ai aussi rajouté le le nombre de personne total dans le classement :
team rank :
2438 / 14842

Le team rank est exact vu qu'il se base sur la page de stats de la team, le global rank doit être faux puisqu'il se base sur le global rank du dernier de la team française, qui n'est pas forcément dernier mondial, mais à mon avis on doit pas être loin, et c'est juste à titre indicatif

Le voila :

#!/bin/bash
#
# But : Lancer fah en smp et afficher des informations complémentaire à fahmon
# Créateur : Ras'
#

pseudo="Ras'"

color()
{
printf '\033[%sm%s\033[m\n' "$@" 
}

sleep 2
zenity --question --title="Folding @ Home" --text="Hey $pseudo !
On plie aujourd'hui ?"
if ! [[ $? == "0" ]]
then exit
fi

cd $HOME/Folding/Fah
(./fah6 -smp >/dev/null)&


wget -q -O .stats http://fah-web.stanford.edu/teamstats/team51.html
t=0

while true
do
	until [[ $t -ne "60" ]]
	do
	wget -q -O .stats http://fah-web.stanford.edu/teamstats/team51.html
	t=0
	done

temp=$( sensors | cut -f1 -d "(" | grep -o '+[0-9]*.[0-9]' | grep -o "[0-9]*" | head -1 )
	if [[ $temp -gt 80 ]]
	then
	killall -9 fah6
	echo "Température des cores trop élevé ( > 80°C )
Folding @ Home à été arreté
Veuillez attendre que les processeurs refroidissent avant de relancer f@h"
	fi

clear
echo `color 1 "$pseudo"`
echo `color 0 "Team 51"`
echo `color 34 "$( date +%HH\ %MM\ %SS )"`

echo ""

echo `color 1 "Projet :"`
color 34 "`cat /home/ras/Folding/Fah/FAHlog.txt | grep Project | tail -1 | cut -f2 -d "]"`"
echo ""
echo `color 1 "Avancement :"`
color 34 "`tail /home/ras/Folding/Fah/FAHlog.txt | grep Completed  | tail -2`"

echo ""
echo `color 1 "Cores Temperature :"`
color 34 "`sensors | grep "Core"`"
echo ""

# Stats de l'user
set -- `cat .stats | grep "Ras'" | grep -o "[0-9]*"`
globrank_user="$1"
teamrank_user="$2"
credits_user="$3"
wufolded_user="$4"

# Stats du dernier de la team
set -- `tail -3 .stats | grep -o [0-9]*`
globrank_total="$1"
teamrank_total="$2"


echo `color 1 "Global rank :"`
echo `color 34 "$globrank_user / $globrank_total"`

echo `color 1 "Team rank :"`
echo `color 34 "$teamrank_user / $teamrank_total"`

echo `color 1 "Credits :"`
echo `color 34 "$credits_user"`

echo `color 1 "WU folded :"`
echo `color 34 "$wufolded_user"`

sleep 2m
t=$(( t + 1))
done

L'affichage c'est ça : http://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=207163

Dernière modification par Ras' (Le 05/05/2008, à 16:06)

Ras' · Le 24/05/2008, à 13:09

Petite question pour les utilisateurs de smp :
est ce que la copie de fichier marche bien chez vous ?

J'ai l'impression que nautilus ne prend pas les ressources dont il à besoin, la je suis en train de copier sur mon dde et ça va à 3.4Mio/s pas très vif pour de l'usb 2 :\
peut être que le problème vien d'ailleurs mais c'est le seul truc logique que j'ai trouvé ...

www.rzr.online.fr · Le 25/05/2008, à 03:12

boinc fait pas la meme chose ?

Ras' · Le 25/05/2008, à 06:59

Boinc ne compte pas F@h dans sa liste.
http://fr.wikipedia.org/wiki/Liste_des_projets_BOINC

F@h c'est pour le calcul du repliement des protéines.

www.rzr.online.fr · Le 25/05/2008, à 11:54

Ras' a écrit :

Boinc ne compte pas F@h dans sa liste.
http://fr.wikipedia.org/wiki/Liste_des_projets_BOINC
F@h c'est pour le calcul du repliement des protéines.

dommage

une piste : http://folding.stanford.edu/English/FAQ-highperformance#ntoc10

par contre y a protein@home sous boinc

sinon ya une equipe linux users ww sur rosetta :
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_members.php?teamid=9&sort_by=total_credit&offset=0

--
http://rzr.online.fr/q/compute

Dernière modification par www.rzr.online.fr (Le 25/05/2008, à 11:55)

Ras' · Le 25/05/2008, à 12:49

Mouai, enfin on m'avais parlé d'inconvénients avec boinc (genre pour les délais de renvoi au serveur je crois, je me rapelle plus trop...), et puis comme je fais que du folding il n'y a aucun interêt à l'utiliser.

sylvain1970 · Le 26/05/2008, à 19:50

Merci pour le script Ras'.
Je vais voir si je peux l'adapter à mes besoins.

YannUbuntu · Le 29/10/2008, à 03:04

Bonjour, je fais un UP au sujet du nouvel installateur de F@H :
http://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=235967

Quelqu'un a-t-il essayé?

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