Ubuntu-fr

xubu1957

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

Bonjour,

@nany

Pour info > yiweiniu.github.io/blog/2019/07/Install-Update-R-and-R-packages

> forums.cirad.fr/logiciel-R/viewtopic.php?t=10357

Dernière modification par xubu1957 (Le 19/10/2021, à 09:12)

---

Conseils pour les nouveaux demandeurs et pas qu'eux
Important : Pensez à passer vos sujets en [Résolu] lorsque ceux-ci le sont, au début du titre en cliquant sur Modifier sous le premier message, et un bref récapitulatif de la solution à la fin de celui-ci. Merci.                   Membre de Linux-Azur

nany

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

Bonjour,

Toutes mes excuses pour ce retour tardif mais grosse semaine donc grosse fatigue donc j’ai préféré mon lit le soir plutôt que le forum.

Ceci étant dit, j’ai fait des tests en machine virtuelle pour comprendre la procédure de https://ibootweb.com/questions/1258320/ … einstaller.

Alors donne (dans r-studio) tous les retours de :

.libPaths("~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1")

.libPaths()

old_packages <- installed.packages(lib.loc = "~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6")

old_packages <- as.data.frame(old_packages)

list.of.packages <- unlist(old_packages$Package)

remove.packages( installed.packages( priority = "NA" )[,1] )

new.packages <- list.of.packages[!(list.of.packages %in% installed.packages()[,"Package"])]

if(length(new.packages)) install.packages(new.packages)

lapply(list.of.packages,function(x){library(x,character.only=TRUE)})

install.packages("pid")

---

Le mot de passe sudo ne s'affiche pas - Comment bien utiliser les balises BBcode
Retour aux sources.
Urtikan.net - https://youtu.be/2uznaTjvb7I
LIBRARIES ARE NOT BOOK-STORES!

klark85

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

Bonjour Nany,
Merci beaucoup. Voici les résultats des commandes:

> .libPaths("~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1")
> .libPaths()
[1] "/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1"
[2] "/usr/local/lib/R/site-library"                  
[3] "/usr/lib/R/site-library"                        
[4] "/usr/lib/R/library"                             
> old_packages <- installed.packages(lib.loc = "~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6")
> old_packages <- as.data.frame(old_packages)
> list.of.packages <- unlist(old_packages$Package)
> remove.packages( installed.packages( priority = "NA" )[,1] )
Elimination des packages de ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1’
(car ‘lib’ n'est pas spécifié)
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘cli’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘colorspace’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘combinat’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘conf.design’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘crayon’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘digest’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘ellipsis’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘fansi’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘farver’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘ggplot2’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘glue’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘igraph’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘isoband’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘labeling’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘lifecycle’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘lmtest’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘magrittr’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘mathjaxr’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘munsell’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘numbers’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘pillar’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘pkgconfig’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘png’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘polynom’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘R6’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘RColorBrewer’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘scales’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘scatterplot3d’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘sets’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘sfsmisc’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘tibble’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘utf8’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘vcd’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘vctrs’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘viridisLite’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘withr’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘zoo’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘brio’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘callr’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘cli’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘colorspace’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘cpp11’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘crayon’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘desc’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘diffobj’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘digest’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘ellipsis’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘evaluate’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘fansi’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘farver’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘ggplot2’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘glue’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘isoband’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘jsonlite’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘labeling’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘lifecycle’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘magrittr’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘munsell’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘pillar’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘pkgconfig’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘pkgload’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘praise’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘processx’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘ps’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘R6’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘RColorBrewer’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘rematch2’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘rprojroot’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘rstudioapi’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘scales’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘svglite’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘systemfonts’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘testthat’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘tibble’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘utf8’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘vctrs’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘viridisLite’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘waldo’ n'est trouvé
Warning in remove.packages :
  aucun package nommé ‘withr’ n'est trouvé
> new.packages <- list.of.packages[!(list.of.packages %in% installed.packages()[,"Package"])]
> if(length(new.packages)) install.packages(new.packages)
> lapply(list.of.packages,function(x){library(x,character.only=TRUE)})
 Erreur : le chargement du package ou de l'espace de noms a échoué pour ‘cli’ :
le package ‘cli’ a été installé avant R 4.0.0 : veuillez le réinstaller, s'il-vous-plait 
> install.packages("pid")
Installation du package dans ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1’
(car ‘lib’ n'est pas spécifié)
installation des dépendances ‘gmp’, ‘partitions’, ‘FrF2’, ‘DoE.base’, ‘FrF2.catlg128’

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/gmp_0.6-2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 161933 bytes (158 KB)
==================================================
downloaded 158 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/partitions_1.10-4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 684304 bytes (668 KB)
==================================================
downloaded 668 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/FrF2_2.2-2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 329742 bytes (322 KB)
==================================================
downloaded 322 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/DoE.base_1.2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 768630 bytes (750 KB)
==================================================
downloaded 750 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/FrF2.catlg128_1.2-1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 4369913 bytes (4.2 MB)
==================================================
downloaded 4.2 MB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/pid_0.50.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1637197 bytes (1.6 MB)
==================================================
downloaded 1.6 MB

* installing *source* package ‘gmp’ ...
** package ‘gmp’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
checking for gcc... gcc -std=gnu99
checking whether the C compiler works... yes
checking for C compiler default output file name... a.out
checking for suffix of executables... 
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes
checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E
checking whether we are using the GNU C++ compiler... yes
checking whether g++ -std=gnu++14 accepts -g... yes
checking for __gmpz_ui_sub in -lgmp... yes
configure: creating ./config.status
config.status: creating src/Makevars
** libs
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c apply.cc -o apply.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c biginteger.cc -o biginteger.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c bigintegerR.cc -o bigintegerR.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c bigmod.cc -o bigmod.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c bigrational.cc -o bigrational.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c bigrationalR.cc -o bigrationalR.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c bigvec.cc -o bigvec.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c bigvec_q.cc -o bigvec_q.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c extract_matrix.cc -o extract_matrix.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c factor.cc -o factor.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c factorize.cc -o factorize.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c init.cc -o init.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c matrix.cc -o matrix.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c matrixq.cc -o matrixq.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c solve.cc -o solve.o
g++ -std=gnu++14 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -o gmp.so apply.o biginteger.o bigintegerR.o bigmod.o bigrational.o bigrationalR.o bigvec.o bigvec_q.o extract_matrix.o factor.o factorize.o init.o matrix.o matrixq.o solve.o -L/usr/local/lib/ -lgmp -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/00LOCK-gmp/00new/gmp/libs
** R
** data
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Creating a generic function for ‘which.max’ from package ‘base’ in package ‘gmp’
Creating a generic function for ‘which.min’ from package ‘base’ in package ‘gmp’
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded from temporary location
** checking absolute paths in shared objects and dynamic libraries
** testing if installed package can be loaded from final location
** testing if installed package keeps a record of temporary installation path
* DONE (gmp)
* installing *source* package ‘partitions’ ...
** package ‘partitions’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
** libs
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c app.cpp -o app.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c partitions.c -o partitions.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c partitions_init.c -o partitions_init.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c permutations.c -o permutations.o
g++ -std=gnu++14 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -o partitions.so app.o partitions.o partitions_init.o permutations.o -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/00LOCK-partitions/00new/partitions/libs
** R
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Erreur : le package ‘mathjaxr’ a été installé avant R 4.0.0 : veuillez le réinstaller, s'il-vous-plait
Exécution arrêtée
ERROR: lazy loading failed for package ‘partitions’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/partitions’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘partitions’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘partitions’ is not available for package ‘DoE.base’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/DoE.base’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘DoE.base’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘DoE.base’ is not available for package ‘FrF2’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/FrF2’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘FrF2’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘FrF2’ is not available for package ‘FrF2.catlg128’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/FrF2.catlg128’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘FrF2.catlg128’ had non-zero exit status
ERROR: dependencies ‘FrF2’, ‘DoE.base’, ‘FrF2.catlg128’ are not available for package ‘pid’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/pid’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘pid’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
	‘/tmp/Rtmp3v1c52/downloaded_packages’

Dernière modification par klark85 (Le 25/10/2021, à 22:12)

nany

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

Punaise, c’est un vrai sac de nœuds !
Bon, il va falloir être plus radical.
Dans le terminal, donc hors r-studio, donne le retour de :

cd && rm -rv R .RData

Puis va dans r-studio et lance :

install.packages("pid")

---

Le mot de passe sudo ne s'affiche pas - Comment bien utiliser les balises BBcode
Retour aux sources.
Urtikan.net - https://youtu.be/2uznaTjvb7I
LIBRARIES ARE NOT BOOK-STORES!

klark85

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

> install.packages("pid")
Installation du package dans ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1’
(car ‘lib’ n'est pas spécifié)
Warning in install.packages :
  'lib = "/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1"' is not writable
Voulez-vous plutôt utiliser une bibliothèque personnelle ? (oui/Non/annuler) oui
Would you like to create a personal library
‘~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1’
to install packages into? (oui/Non/annuler) oui
installation des dépendances ‘gmp’, ‘partitions’, ‘FrF2’, ‘DoE.base’, ‘FrF2.catlg128’

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/gmp_0.6-2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 161933 bytes (158 KB)
==================================================
downloaded 158 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/partitions_1.10-4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 684304 bytes (668 KB)
==================================================
downloaded 668 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/FrF2_2.2-2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 329742 bytes (322 KB)
==================================================
downloaded 322 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/DoE.base_1.2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 768630 bytes (750 KB)
==================================================
downloaded 750 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/FrF2.catlg128_1.2-1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 4369913 bytes (4.2 MB)
==================================================
downloaded 4.2 MB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/pid_0.50.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1637197 bytes (1.6 MB)
==================================================
downloaded 1.6 MB

* installing *source* package ‘gmp’ ...
** package ‘gmp’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
checking for gcc... gcc -std=gnu99
checking whether the C compiler works... yes
checking for C compiler default output file name... a.out
checking for suffix of executables... 
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes
checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E
checking whether we are using the GNU C++ compiler... yes
checking whether g++ -std=gnu++14 accepts -g... yes
checking for __gmpz_ui_sub in -lgmp... yes
configure: creating ./config.status
config.status: creating src/Makevars
** libs
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c apply.cc -o apply.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c biginteger.cc -o biginteger.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c bigintegerR.cc -o bigintegerR.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c bigmod.cc -o bigmod.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c bigrational.cc -o bigrational.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c bigrationalR.cc -o bigrationalR.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c bigvec.cc -o bigvec.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c bigvec_q.cc -o bigvec_q.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c extract_matrix.cc -o extract_matrix.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c factor.cc -o factor.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c factorize.cc -o factorize.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c init.cc -o init.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c matrix.cc -o matrix.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c matrixq.cc -o matrixq.o
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include/      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c solve.cc -o solve.o
g++ -std=gnu++14 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -o gmp.so apply.o biginteger.o bigintegerR.o bigmod.o bigrational.o bigrationalR.o bigvec.o bigvec_q.o extract_matrix.o factor.o factorize.o init.o matrix.o matrixq.o solve.o -L/usr/local/lib/ -lgmp -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/00LOCK-gmp/00new/gmp/libs
** R
** data
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Creating a generic function for ‘which.max’ from package ‘base’ in package ‘gmp’
Creating a generic function for ‘which.min’ from package ‘base’ in package ‘gmp’
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded from temporary location
** checking absolute paths in shared objects and dynamic libraries
** testing if installed package can be loaded from final location
** testing if installed package keeps a record of temporary installation path
* DONE (gmp)
* installing *source* package ‘partitions’ ...
** package ‘partitions’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
** libs
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c app.cpp -o app.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c partitions.c -o partitions.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c partitions_init.c -o partitions_init.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c permutations.c -o permutations.o
g++ -std=gnu++14 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -o partitions.so app.o partitions.o partitions_init.o permutations.o -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/00LOCK-partitions/00new/partitions/libs
** R
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Erreur : le package ‘mathjaxr’ a été installé avant R 4.0.0 : veuillez le réinstaller, s'il-vous-plait
Exécution arrêtée
ERROR: lazy loading failed for package ‘partitions’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/partitions’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘partitions’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘partitions’ is not available for package ‘DoE.base’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/DoE.base’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘DoE.base’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘DoE.base’ is not available for package ‘FrF2’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/FrF2’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘FrF2’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘FrF2’ is not available for package ‘FrF2.catlg128’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/FrF2.catlg128’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘FrF2.catlg128’ had non-zero exit status
ERROR: dependencies ‘FrF2’, ‘DoE.base’, ‘FrF2.catlg128’ are not available for package ‘pid’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/pid’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘pid’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
	‘/tmp/Rtmp3v1c52/downloaded_packages’

nany

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

J’aurais bien aimé voir le retour de la commande de suppression car j’ai un doute sur la casse.

Bon, donne le retour de :

cd && rm -v .R{d,D}ata

Dernière modification par nany (Le 26/10/2021, à 16:18)

---

Le mot de passe sudo ne s'affiche pas - Comment bien utiliser les balises BBcode
Retour aux sources.
Urtikan.net - https://youtu.be/2uznaTjvb7I
LIBRARIES ARE NOT BOOK-STORES!

klark85

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

cd && rm -rv R .RData
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/INDEX' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/Meta/package.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/Meta/nsInfo.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/Meta/Rd.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/Meta/hsearch.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/Meta/features.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/Meta/links.rds' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/Meta' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/DESCRIPTION' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/html/R.css' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/html/00Index.html' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/html' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/R/combinat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/R/combinat.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/R/combinat.rdx' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/NAMESPACE' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/help/combinat.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/help/combinat.rdx' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/help/aliases.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/help/paths.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/help/AnIndex' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat/help' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/combinat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/NEWS.md' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/INDEX' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/Meta/package.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/Meta/nsInfo.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/Meta/Rd.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/Meta/hsearch.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/Meta/features.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/Meta/links.rds' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/Meta' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/DESCRIPTION' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/libs/ellipsis.so' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/libs' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/html/R.css' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/html/00Index.html' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/html' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/LICENSE' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/R/ellipsis' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/R/ellipsis.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/R/ellipsis.rdx' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/NAMESPACE' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/help/ellipsis.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/help/aliases.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/help/ellipsis.rdx' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/help/paths.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/help/AnIndex' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis/help' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ellipsis' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/INDEX' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/Meta/package.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/Meta/nsInfo.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/Meta/Rd.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/Meta/hsearch.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/Meta/features.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/Meta/links.rds' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/Meta' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/DESCRIPTION' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/html/R.css' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/html/00Index.html' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/html' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/R/conf.design' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/R/conf.design.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/R/conf.design.rdx' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/NAMESPACE' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/help/conf.design.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/help/conf.design.rdx' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/help/aliases.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/help/paths.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/help/AnIndex' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design/help' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/conf.design' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/NEWS.md' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/INDEX' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/Meta/package.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/Meta/nsInfo.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/Meta/Rd.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/Meta/hsearch.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/Meta/features.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/Meta/vignette.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/Meta/links.rds' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/Meta' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/doc/sgr-in-rmd.Rmd' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/doc/sgr-in-rmd.html' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/doc/index.html' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/doc/sgr-in-rmd.R' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/doc' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/DESCRIPTION' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/libs/fansi.so' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/libs' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/html/R.css' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/html/00Index.html' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/html' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/R/fansi' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/R/fansi.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/R/fansi.rdx' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/NAMESPACE' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/help/fansi.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/help/fansi.rdx' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/help/aliases.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/help/paths.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/help/AnIndex' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi/help' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/fansi' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/INDEX' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/Meta/package.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/Meta/nsInfo.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/Meta/Rd.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/Meta/hsearch.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/Meta/features.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/Meta/links.rds' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/Meta' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/img/Rlogo.png' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/img' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/DESCRIPTION' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/libs/png.so' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/libs' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/html/R.css' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/html/00Index.html' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/html' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/R/png' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/R/png.rdx' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/R/png.rdb' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/NEWS' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/NAMESPACE' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/help/aliases.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/help/png.rdx' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/help/png.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/help/paths.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png/help/AnIndex' supprimé
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répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/png' supprimé
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'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/doc/zoo-quickref.Rnw' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/doc/zoo-read.pdf' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/doc/zoo-read.Rnw' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/doc/index.html' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/doc/zoo-read.R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/doc/zoo-quickref.R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/doc/sunw.rda' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/doc/zoo-faq.R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/doc/zoo-design.Rnw' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/doc/MSFT.rda' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/doc/zoo-faq.Rnw' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/doc/zoo-design.R' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/doc' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/WISHLIST' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/DESCRIPTION' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/libs/zoo.so' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/libs' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/html/R.css' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/html/00Index.html' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/html' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/R/zoo.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/R/zoo' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/R/zoo.rdx' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/NEWS' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/NAMESPACE' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/help/zoo.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/help/aliases.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/help/paths.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/help/AnIndex' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/help/zoo.rdx' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo/help' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/zoo' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/INDEX' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/Meta/package.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/Meta/data.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/Meta/nsInfo.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/Meta/Rd.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/Meta/hsearch.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/Meta/features.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/Meta/links.rds' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/Meta' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/data/Oakley2.R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/data/Oakley1.R' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/data' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/DESCRIPTION' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/libs/gmp.so' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/libs' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/html/R.css' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/html/00Index.html' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/html' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/R/gmp' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/R/gmp.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/R/gmp.rdx' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/NAMESPACE' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/help/gmp.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/help/gmp.rdx' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/help/aliases.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/help/paths.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/help/AnIndex' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp/help' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/gmp' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/scripts/ch05.R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/scripts/ch06.R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/scripts/sims.rda' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/scripts/ch03.R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/scripts/ch01.R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/scripts/ch02.R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/scripts/ch04.R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/scripts/runme.R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/scripts/ch08.R' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/scripts' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/INDEX' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/fr/LC_MESSAGES/nlme.mo' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/fr/LC_MESSAGES/R-nlme.mo' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/fr/LC_MESSAGES' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/fr' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/ko/LC_MESSAGES/nlme.mo' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/ko/LC_MESSAGES/R-nlme.mo' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/ko/LC_MESSAGES' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/ko' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/pl/LC_MESSAGES/nlme.mo' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/pl/LC_MESSAGES/R-nlme.mo' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/pl/LC_MESSAGES' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/pl' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/de/LC_MESSAGES/nlme.mo' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/de/LC_MESSAGES/R-nlme.mo' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/de/LC_MESSAGES' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/de' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/en@quot/LC_MESSAGES/nlme.mo' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/en@quot/LC_MESSAGES/R-nlme.mo' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/en@quot/LC_MESSAGES' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po/en@quot' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/po' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/Meta/package.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/Meta/data.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/Meta/nsInfo.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/Meta/Rd.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/Meta/hsearch.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/Meta/features.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/Meta/links.rds' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/Meta' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/CITATION' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/data/Rdata.rdx' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/data/Rdata.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/data/Rdata.rdb' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/data' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/mlbook/ch05.R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/mlbook/ch04.R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/mlbook/README' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/mlbook' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/DESCRIPTION' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/libs/nlme.so' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/libs' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/html/R.css' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/html/00Index.html' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/html' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/R/nlme.rdx' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/R/nlme' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/R/nlme.rdb' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/LICENCE' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/NAMESPACE' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/help/nlme.rdx' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/help/aliases.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/help/paths.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/help/AnIndex' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/help/nlme.rdb' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme/help' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/nlme' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/INDEX' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/PP.files' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/fr/LC_MESSAGES/R-spatial.mo' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/fr/LC_MESSAGES' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/fr' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/ko/LC_MESSAGES/R-spatial.mo' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/ko/LC_MESSAGES' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/ko' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/pl/LC_MESSAGES/R-spatial.mo' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/pl/LC_MESSAGES' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/pl' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/de/LC_MESSAGES/R-spatial.mo' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/de/LC_MESSAGES' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/de' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/it/LC_MESSAGES/R-spatial.mo' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/it/LC_MESSAGES' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/it' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/en@quot/LC_MESSAGES/R-spatial.mo' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/en@quot/LC_MESSAGES' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po/en@quot' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/po' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/Meta/package.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/Meta/nsInfo.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/Meta/Rd.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/Meta/hsearch.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/Meta/features.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/Meta/links.rds' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/Meta' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/CITATION' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/fig2b.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/redwood.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/fig2a.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/tokyo.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/towns.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/fig3a.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/pereg.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/davis.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/stowns1.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/drumlin.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/nztrees.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/agter.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/grocery.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/schools.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/cells.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/hccells.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/fig1c.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/pairfn.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/fig3c.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/pines.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/eagles.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/fig3b.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/caveolae.dat' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata/fig1b.dat' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/ppdata' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/DESCRIPTION' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/libs/spatial.so' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/libs' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/html/R.css' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/html/00Index.html' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/html' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/R/spatial.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/R/spatial.rdx' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/R/spatial' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/R' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/NEWS' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/NAMESPACE' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/help/spatial.rdb' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/help/spatial.rdx' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/help/aliases.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/help/paths.rds' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/help/AnIndex' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial/help' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/spatial' supprimé
'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/.Rhistory' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1' supprimé
répertoire 'R/x86_64-pc-linux-gnu-library' supprimé
répertoire 'R' supprimé
'.RData' supprimé
(base) user@user:~$ 
(base) user@user:~$ cd && rm -v .R{d,D}ata
rm: impossible de supprimer '.Rdata': Aucun fichier ou dossier de ce type
rm: impossible de supprimer '.RData': Aucun fichier ou dossier de ce type

Dernière modification par klark85 (Le 26/10/2021, à 17:20)

nany

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

Je n’arrive pas à comprendre pourquoi tu as toujours la même erreur malgré les suppressions.

On va désinstaller R et le réinstaller en espérant que cette fois-ci ça passera.
Donne les retours de :

dpkg -l r-* | awk '/^ii/{print $2}' | xargs -r sudo dpkg -P

sudo apt install r-base r-base-dev

---

Le mot de passe sudo ne s'affiche pas - Comment bien utiliser les balises BBcode
Retour aux sources.
Urtikan.net - https://youtu.be/2uznaTjvb7I
LIBRARIES ARE NOT BOOK-STORES!

klark85

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

(base) user@user :~/Téléchargements$ dpkg -l r-* | awk '/^ii/{print $2}' | xargs -r sudo dpkg -P
[sudo] Mot de passe de user : 
(Lecture de la base de données... 383938 fichiers et répertoires déjà installés.)
Suppression de r-base (4.1.1-1.2004.0) ...
Suppression de r-base-dev (4.1.1-1.2004.0) ...
Suppression de r-base-html (4.1.1-1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-ggplot2 (3.3.5-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-gtable (0.3.0+dfsg-1.1~ubuntu20.04.1~ppa1) ...
Suppression de r-cran-isoband (0.2.5-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-scales (1.1.1-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-svglite (2.0.0-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-systemfonts (1.0.3-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-testthat (3.1.0-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-viridislite (0.4.0-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-waldo (0.3.1-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-doc-html (4.1.1-1.2004.0) ...
Suppression de r-recommended (4.1.1-1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-boot (1.3-28-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-brio (1.1.2-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-callr (3.7.0-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-class (7.3-19-1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-cluster (2.1.2-1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-codetools (0.2-18-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-cpp11 (0.4.0-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-diffobj (0.3.5-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-digest (0.6.28-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-evaluate (0.14-1.1~ubuntu20.04.1~ppa1) ...
Suppression de r-cran-farver (2.1.0-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-foreign (0.8.81-1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-jsonlite (1.7.2-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-kernsmooth (2.23-20-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-labeling (0.4.2-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-mass (7.3-54-1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-mgcv (1.8-38-1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-munsell (0.5.0-1.1~ubuntu20.04.1~ppa1) ...
Suppression de r-cran-nlme (3.1.152-1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-nnet (7.3-16-1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-pkgload (1.2.3-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-praise (1.0.0-3.1~ubuntu20.04.1~ppa1) ...
Suppression de r-cran-processx (3.5.2-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-ps (1.6.0-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-rcolorbrewer (1.1-2-2.1~ubuntu20.04.1~ppa1) ...
Suppression de r-cran-rematch2 (2.1.2-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-rpart (4.1-15-2.2004.0) ...
Suppression de r-cran-rstudioapi (0.13-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-spatial (7.3-14-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-survival (3.2-13-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-tibble (3.1.5-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-withr (2.4.2-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-colorspace (2.0-2-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-desc (1.4.0-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-magrittr (2.0.1-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-matrix (1.3-4-1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-pillar (1.6.4-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-pkgconfig (2.0.3-1.1~ubuntu20.04.1~ppa1) ...
Suppression de r-cran-r6 (2.5.1-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-rprojroot (2.0.2-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-utf8 (1.2.2-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-vctrs (0.3.8-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-cli (3.0.1-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-crayon (1.4.1-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-ellipsis (0.3.2-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-fansi (0.5.0-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-lattice (0.20-45-1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-lifecycle (1.0.1-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-rlang (0.4.12-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-cran-glue (1.4.2-1cran1.2004.0) ...
Suppression de r-base-core (4.1.1-1.2004.0) ...
Purge des fichiers de configuration de r-base-core (4.1.1-1.2004.0) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour tex-common (6.13) ...
Running mktexlsr. This may take some time... done.
Traitement des actions différées (« triggers ») pour man-db (2.9.1-1) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour hicolor-icon-theme (0.17-2) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour gnome-menus (3.36.0-1ubuntu1) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour desktop-file-utils (0.24-1ubuntu3) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour mime-support (3.64ubuntu1) ...
(base) user@user :~/Téléchargements$ sudo apt install r-base r-base-dev
Lecture des listes de paquets... Fait
Construction de l'arbre des dépendances       
Lecture des informations d'état... Fait
Les paquets supplémentaires suivants seront installés : 
  r-base-core r-base-html r-cran-boot r-cran-class r-cran-cluster
  r-cran-codetools r-cran-foreign r-cran-kernsmooth r-cran-lattice r-cran-mass
  r-cran-matrix r-cran-mgcv r-cran-nlme r-cran-nnet r-cran-rpart
  r-cran-spatial r-cran-survival r-doc-html r-recommended
Paquets suggérés :
  elpa-ess r-doc-info | r-doc-pdf r-mathlib
Les NOUVEAUX paquets suivants seront installés :
  r-base r-base-core r-base-dev r-base-html r-cran-boot r-cran-class
  r-cran-cluster r-cran-codetools r-cran-foreign r-cran-kernsmooth
  r-cran-lattice r-cran-mass r-cran-matrix r-cran-mgcv r-cran-nlme r-cran-nnet
  r-cran-rpart r-cran-spatial r-cran-survival r-doc-html r-recommended
0 mis à jour, 21 nouvellement installés, 0 à enlever et 2 non mis à jour.
Il est nécessaire de prendre 46.0 Mo/46.8 Mo dans les archives.
Après cette opération, 72.8 Mo d'espace disque supplémentaires seront utilisés.
Souhaitez-vous continuer ? [O/n] o
Réception de :1 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-base-core 4.1.1-1.2004.0 [25.9 MB]
Réception de :2 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-cran-boot 1.3-28-1cran1.2004.0 [619 kB]
Réception de :3 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-cran-cluster 2.1.2-1.2004.0 [540 kB]
Réception de :4 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-cran-foreign 0.8.81-1.2004.0 [238 kB]
Réception de :5 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-cran-kernsmooth 2.23-20-1cran1.2004.0 [89.7 kB]
Réception de :6 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-cran-lattice 0.20-45-1.2004.0 [1,134 kB]
Réception de :7 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-cran-nlme 3.1.152-1.2004.0 [2,227 kB]
Réception de :8 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-cran-matrix 1.3-4-1.2004.0 [3,573 kB]
Réception de :9 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-cran-mgcv 1.8-38-1.2004.0 [2,969 kB]
Réception de :10 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-cran-survival 3.2-13-1cran1.2004.0 [6,614 kB]
Réception de :11 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-cran-mass 7.3-54-1.2004.0 [1,114 kB]
Réception de :12 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-cran-class 7.3-19-1.2004.0 [87.7 kB]
Réception de :13 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-cran-nnet 7.3-16-1.2004.0 [112 kB]
Réception de :14 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-cran-codetools 0.2-18-1cran1.2004.0 [90.0 kB]
Réception de :15 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-recommended 4.1.1-1.2004.0 [2,776 B]
Réception de :16 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-base 4.1.1-1.2004.0 [44.4 kB]
Réception de :17 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-base-dev 4.1.1-1.2004.0 [4,488 B]
Réception de :18 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-base-html 4.1.1-1.2004.0 [91.6 kB]
Réception de :19 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ r-doc-html 4.1.1-1.2004.0 [579 kB]
46.0 Mo réceptionnés en 1min 5s (709 ko/s)                                     
Sélection du paquet r-base-core précédemment désélectionné.
(Lecture de la base de données... 379666 fichiers et répertoires déjà installés.
)
Préparation du dépaquetage de .../00-r-base-core_4.1.1-1.2004.0_amd64.deb ...
Dépaquetage de r-base-core (4.1.1-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-boot précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../01-r-cran-boot_1.3-28-1cran1.2004.0_all.deb ..
.
Dépaquetage de r-cran-boot (1.3-28-1cran1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-cluster précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../02-r-cran-cluster_2.1.2-1.2004.0_amd64.deb ...
Dépaquetage de r-cran-cluster (2.1.2-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-foreign précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../03-r-cran-foreign_0.8.81-1.2004.0_amd64.deb ..
.
Dépaquetage de r-cran-foreign (0.8.81-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-kernsmooth précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../04-r-cran-kernsmooth_2.23-20-1cran1.2004.0_amd
64.deb ...
Dépaquetage de r-cran-kernsmooth (2.23-20-1cran1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-lattice précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../05-r-cran-lattice_0.20-45-1.2004.0_amd64.deb .
..
Dépaquetage de r-cran-lattice (0.20-45-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-nlme précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../06-r-cran-nlme_3.1.152-1.2004.0_amd64.deb ...
Dépaquetage de r-cran-nlme (3.1.152-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-matrix précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../07-r-cran-matrix_1.3-4-1.2004.0_amd64.deb ...
Dépaquetage de r-cran-matrix (1.3-4-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-mgcv précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../08-r-cran-mgcv_1.8-38-1.2004.0_amd64.deb ...
Dépaquetage de r-cran-mgcv (1.8-38-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-survival précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../09-r-cran-survival_3.2-13-1cran1.2004.0_amd64.
deb ...
Dépaquetage de r-cran-survival (3.2-13-1cran1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-rpart précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../10-r-cran-rpart_4.1-15-2.2004.0_amd64.deb ...
Dépaquetage de r-cran-rpart (4.1-15-2.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-mass précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../11-r-cran-mass_7.3-54-1.2004.0_amd64.deb ...
Dépaquetage de r-cran-mass (7.3-54-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-class précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../12-r-cran-class_7.3-19-1.2004.0_amd64.deb ...
Dépaquetage de r-cran-class (7.3-19-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-nnet précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../13-r-cran-nnet_7.3-16-1.2004.0_amd64.deb ...
Dépaquetage de r-cran-nnet (7.3-16-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-spatial précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../14-r-cran-spatial_7.3-14-1cran1.2004.0_amd64.d
eb ...
Dépaquetage de r-cran-spatial (7.3-14-1cran1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-cran-codetools précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../15-r-cran-codetools_0.2-18-1cran1.2004.0_all.d
eb ...
Dépaquetage de r-cran-codetools (0.2-18-1cran1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-recommended précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../16-r-recommended_4.1.1-1.2004.0_all.deb ...
Dépaquetage de r-recommended (4.1.1-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-base précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../17-r-base_4.1.1-1.2004.0_all.deb ...
Dépaquetage de r-base (4.1.1-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-base-dev précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../18-r-base-dev_4.1.1-1.2004.0_all.deb ...
Dépaquetage de r-base-dev (4.1.1-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-base-html précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../19-r-base-html_4.1.1-1.2004.0_all.deb ...
Dépaquetage de r-base-html (4.1.1-1.2004.0) ...
Sélection du paquet r-doc-html précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../20-r-doc-html_4.1.1-1.2004.0_all.deb ...
Dépaquetage de r-doc-html (4.1.1-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-doc-html (4.1.1-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-base-core (4.1.1-1.2004.0) ...

Creating config file /etc/R/Renviron with new version
Paramétrage de r-cran-lattice (0.20-45-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-nlme (3.1.152-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-kernsmooth (2.23-20-1cran1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-cluster (2.1.2-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-nnet (7.3-16-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-codetools (0.2-18-1cran1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-boot (1.3-28-1cran1.2004.0) ...
Paramétrage de r-base-dev (4.1.1-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-spatial (7.3-14-1cran1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-mass (7.3-54-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-foreign (0.8.81-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-base-html (4.1.1-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-matrix (1.3-4-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-mgcv (1.8-38-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-class (7.3-19-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-survival (3.2-13-1cran1.2004.0) ...
Paramétrage de r-cran-rpart (4.1-15-2.2004.0) ...
Paramétrage de r-recommended (4.1.1-1.2004.0) ...
Paramétrage de r-base (4.1.1-1.2004.0) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour desktop-file-utils (0.24-1u
buntu3) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour mime-support (3.64ubuntu1) 
...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour hicolor-icon-theme (0.17-2)
 ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour gnome-menus (3.36.0-1ubuntu
1) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour man-db (2.9.1-1) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour tex-common (6.13) ...
Running mktexlsr. This may take some time... done.
Traitement des actions différées (« triggers ») pour install-info (6.7.0.dfsg.2-
5) ...
(base) user@user :~/Téléchargements$ 

nany

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

OK, maintenant tente l’installation dans R :

install.packages("pid")

---

Le mot de passe sudo ne s'affiche pas - Comment bien utiliser les balises BBcode
Retour aux sources.
Urtikan.net - https://youtu.be/2uznaTjvb7I
LIBRARIES ARE NOT BOOK-STORES!

klark85

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

install.packages("pid")
Installation du package dans ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1’
(car ‘lib’ n'est pas spécifié)
installation des dépendances ‘partitions’, ‘FrF2’, ‘DoE.base’, ‘FrF2.catlg128’

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/partitions_1.10-4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 684304 bytes (668 KB)
==================================================
downloaded 668 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/FrF2_2.2-2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 329742 bytes (322 KB)
==================================================
downloaded 322 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/DoE.base_1.2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 768630 bytes (750 KB)
==================================================
downloaded 750 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/FrF2.catlg128_1.2-1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 4369913 bytes (4.2 MB)
==================================================
downloaded 4.2 MB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/pid_0.50.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1637197 bytes (1.6 MB)
==================================================
downloaded 1.6 MB

* installing *source* package ‘partitions’ ...
** package ‘partitions’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
** libs
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c app.cpp -o app.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c partitions.c -o partitions.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c partitions_init.c -o partitions_init.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c permutations.c -o permutations.o
g++ -std=gnu++14 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -o partitions.so app.o partitions.o partitions_init.o permutations.o -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/00LOCK-partitions/00new/partitions/libs
** R
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Erreur : le package ‘mathjaxr’ a été installé avant R 4.0.0 : veuillez le réinstaller, s'il-vous-plait
Exécution arrêtée
ERROR: lazy loading failed for package ‘partitions’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/partitions’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘partitions’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘partitions’ is not available for package ‘DoE.base’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/DoE.base’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘DoE.base’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘DoE.base’ is not available for package ‘FrF2’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/FrF2’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘FrF2’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘FrF2’ is not available for package ‘FrF2.catlg128’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/FrF2.catlg128’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘FrF2.catlg128’ had non-zero exit status
ERROR: dependencies ‘FrF2’, ‘DoE.base’, ‘FrF2.catlg128’ are not available for package ‘pid’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/pid’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘pid’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
	‘/tmp/Rtmp4ahxL3/downloaded_packages’
> 
> 
> library(pid)
Erreur dans library(pid) : aucun package nommé ‘pid’ n'est trouvéinstall.packages("pid")
Installation du package dans ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1’
(car ‘lib’ n'est pas spécifié)
installation des dépendances ‘partitions’, ‘FrF2’, ‘DoE.base’, ‘FrF2.catlg128’

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/partitions_1.10-4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 684304 bytes (668 KB)
==================================================
downloaded 668 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/FrF2_2.2-2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 329742 bytes (322 KB)
==================================================
downloaded 322 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/DoE.base_1.2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 768630 bytes (750 KB)
==================================================
downloaded 750 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/FrF2.catlg128_1.2-1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 4369913 bytes (4.2 MB)
==================================================
downloaded 4.2 MB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/pid_0.50.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1637197 bytes (1.6 MB)
==================================================
downloaded 1.6 MB

* installing *source* package ‘partitions’ ...
** package ‘partitions’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
** libs
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c app.cpp -o app.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c partitions.c -o partitions.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c partitions_init.c -o partitions_init.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c permutations.c -o permutations.o
g++ -std=gnu++14 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -o partitions.so app.o partitions.o partitions_init.o permutations.o -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/00LOCK-partitions/00new/partitions/libs
** R
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Erreur : le package ‘mathjaxr’ a été installé avant R 4.0.0 : veuillez le réinstaller, s'il-vous-plait
Exécution arrêtée
ERROR: lazy loading failed for package ‘partitions’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/partitions’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘partitions’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘partitions’ is not available for package ‘DoE.base’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/DoE.base’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘DoE.base’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘DoE.base’ is not available for package ‘FrF2’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/FrF2’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘FrF2’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘FrF2’ is not available for package ‘FrF2.catlg128’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/FrF2.catlg128’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘FrF2.catlg128’ had non-zero exit status
ERROR: dependencies ‘FrF2’, ‘DoE.base’, ‘FrF2.catlg128’ are not available for package ‘pid’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/pid’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘pid’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
	‘/tmp/Rtmp4ahxL3/downloaded_packages’
> 
> 
> library(pid)
Erreur dans library(pid) : aucun package nommé ‘pid’ n'est trouvé

nany

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

C’est incompréhensible ! Même après une purge, ça coince encore.
Bon, tentons de faire ce qu’il demande poliment. Dans R :

remove.packages("mathjaxr")

install.packages("mathjaxr")

install.packages("pid")

---

Le mot de passe sudo ne s'affiche pas - Comment bien utiliser les balises BBcode
Retour aux sources.
Urtikan.net - https://youtu.be/2uznaTjvb7I
LIBRARIES ARE NOT BOOK-STORES!

klark85

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

Oui..

remove.packages("mathjaxr")
Elimination du package de ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1’
(car ‘lib’ n'est pas spécifié)
Error in remove.packages : aucun package nommé ‘mathjaxr’ n'est trouvé
> install.packages("mathjaxr")
Installation du package dans ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1’
(car ‘lib’ n'est pas spécifié)
essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/mathjaxr_1.4-0.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1048270 bytes (1023 KB)
==================================================
downloaded 1023 KB

* installing *source* package ‘mathjaxr’ ...
** package ‘mathjaxr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
** libs
** arch - 
# install.libs.R will minify the Javascript if js is installed
installing via 'install.libs.R' to /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/00LOCK-mathjaxr/00new/mathjaxr
** R
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded from temporary location
** testing if installed package can be loaded from final location
** testing if installed package keeps a record of temporary installation path
* DONE (mathjaxr)

The downloaded source packages are in
	‘/tmp/Rtmp4ahxL3/downloaded_packages’
> install.packages("pid")
Installation du package dans ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1’
(car ‘lib’ n'est pas spécifié)
installation des dépendances ‘partitions’, ‘FrF2’, ‘DoE.base’, ‘FrF2.catlg128’

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/partitions_1.10-4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 684304 bytes (668 KB)
==================================================
downloaded 668 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/FrF2_2.2-2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 329742 bytes (322 KB)
==================================================
downloaded 322 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/DoE.base_1.2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 768630 bytes (750 KB)
==================================================
downloaded 750 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/FrF2.catlg128_1.2-1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 4369913 bytes (4.2 MB)
==================================================
downloaded 4.2 MB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/pid_0.50.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1637197 bytes (1.6 MB)
==================================================
downloaded 1.6 MB

* installing *source* package ‘partitions’ ...
** package ‘partitions’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
** libs
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c app.cpp -o app.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c partitions.c -o partitions.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c partitions_init.c -o partitions_init.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c permutations.c -o permutations.o
g++ -std=gnu++14 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -o partitions.so app.o partitions.o partitions_init.o permutations.o -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/00LOCK-partitions/00new/partitions/libs
** R
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Erreur : le package ‘polynom’ a été installé avant R 4.0.0 : veuillez le réinstaller, s'il-vous-plait
Exécution arrêtée
ERROR: lazy loading failed for package ‘partitions’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/partitions’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘partitions’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘partitions’ is not available for package ‘DoE.base’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/DoE.base’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘DoE.base’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘DoE.base’ is not available for package ‘FrF2’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/FrF2’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘FrF2’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘FrF2’ is not available for package ‘FrF2.catlg128’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/FrF2.catlg128’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘FrF2.catlg128’ had non-zero exit status
ERROR: dependencies ‘FrF2’, ‘DoE.base’, ‘FrF2.catlg128’ are not available for package ‘pid’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/pid’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘pid’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
	‘/tmp/Rtmp4ahxL3/downloaded_packages’
> library(pid)
Erreur dans library(pid) : aucun package nommé ‘pid’ n'est trouvéremove.packages("mathjaxr")
Elimination du package de ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1’
(car ‘lib’ n'est pas spécifié)
Error in remove.packages : aucun package nommé ‘mathjaxr’ n'est trouvé
> install.packages("mathjaxr")
Installation du package dans ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1’
(car ‘lib’ n'est pas spécifié)
essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/mathjaxr_1.4-0.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1048270 bytes (1023 KB)
==================================================
downloaded 1023 KB

* installing *source* package ‘mathjaxr’ ...
** package ‘mathjaxr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
** libs
** arch - 
# install.libs.R will minify the Javascript if js is installed
installing via 'install.libs.R' to /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/00LOCK-mathjaxr/00new/mathjaxr
** R
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded from temporary location
** testing if installed package can be loaded from final location
** testing if installed package keeps a record of temporary installation path
* DONE (mathjaxr)

The downloaded source packages are in
	‘/tmp/Rtmp4ahxL3/downloaded_packages’
> install.packages("pid")
Installation du package dans ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1’
(car ‘lib’ n'est pas spécifié)
installation des dépendances ‘partitions’, ‘FrF2’, ‘DoE.base’, ‘FrF2.catlg128’

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/partitions_1.10-4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 684304 bytes (668 KB)
==================================================
downloaded 668 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/FrF2_2.2-2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 329742 bytes (322 KB)
==================================================
downloaded 322 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/DoE.base_1.2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 768630 bytes (750 KB)
==================================================
downloaded 750 KB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/FrF2.catlg128_1.2-1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 4369913 bytes (4.2 MB)
==================================================
downloaded 4.2 MB

essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/pid_0.50.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1637197 bytes (1.6 MB)
==================================================
downloaded 1.6 MB

* installing *source* package ‘partitions’ ...
** package ‘partitions’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
** libs
g++ -std=gnu++14 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c app.cpp -o app.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c partitions.c -o partitions.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c partitions_init.c -o partitions_init.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-QwogzP/r-base-4.1.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c permutations.c -o permutations.o
g++ -std=gnu++14 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -o partitions.so app.o partitions.o partitions_init.o permutations.o -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/00LOCK-partitions/00new/partitions/libs
** R
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Erreur : le package ‘polynom’ a été installé avant R 4.0.0 : veuillez le réinstaller, s'il-vous-plait
Exécution arrêtée
ERROR: lazy loading failed for package ‘partitions’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/partitions’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘partitions’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘partitions’ is not available for package ‘DoE.base’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/DoE.base’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘DoE.base’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘DoE.base’ is not available for package ‘FrF2’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/FrF2’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘FrF2’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘FrF2’ is not available for package ‘FrF2.catlg128’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/FrF2.catlg128’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘FrF2.catlg128’ had non-zero exit status
ERROR: dependencies ‘FrF2’, ‘DoE.base’, ‘FrF2.catlg128’ are not available for package ‘pid’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/pid’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘pid’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
	‘/tmp/Rtmp4ahxL3/downloaded_packages’
> library(pid)
Erreur dans library(pid) : aucun package nommé ‘pid’ n'est trouvé

nany

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

Bon, eh bien on continue avec polynom :

install.packages("polynom")

install.packages("mathjaxr")

install.packages("pid")

Dernière modification par nany (Le 27/10/2021, à 01:34)

---

Le mot de passe sudo ne s'affiche pas - Comment bien utiliser les balises BBcode
Retour aux sources.
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LIBRARIES ARE NOT BOOK-STORES!

klark85

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

Merci beaucoup nany pour ton aide si précieuse. J'ai réussi finalement à l'installer en suivant les instruction sur ce site :
https://rtask.thinkr.fr/fr/installation … tographie/

nany

Re : Paquets défectueux sont en mode « garder en l'état

GG 

Dernière modification par nany (Le 27/10/2021, à 03:02)

---

Le mot de passe sudo ne s'affiche pas - Comment bien utiliser les balises BBcode
Retour aux sources.
Urtikan.net - https://youtu.be/2uznaTjvb7I
LIBRARIES ARE NOT BOOK-STORES!