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#1 Le 09/03/2020, à 11:04

kevino_linux

Supprimer le même texte plusieurs fois dans une colonne

Bonjour à toute la communauté

Voici mon soucis.

J'ai un fichier éditable qui ressemble à ceci :

data_

loop_
_rlnCtfPowerSpectrum #1
_rlnMicrographName #2
_rlnMicrographMetadata #3
_rlnOpticsGroup #4
_rlnAccumMotionTotal #5
_rlnAccumMotionEarly #6
_rlnAccumMotionLate #7
MotionCorr/job002/in24981-8/raw/Images-Disc1/GridSquare_5311584/Data/FoilHole_5366060_Data_5320469_5320471_20200209_004256_fractions_PS.mrc MotionCorr/job002/in24981-8/raw/Images-Disc1/GridSquare_5311584/Data/FoilHole_5366060_Data_5320469_5320471_20200209_004256_fractions.mrc MotionCorr/job002/in24981-8/raw/Images-Disc1/GridSquare_5311584/Data/FoilHole_5366060_Data_5320469_5320471_20200209_004256_fractions.star            1    96.051383    29.877908    66.173476
MotionCorr/job002/in24981-8/raw/Images-Disc1/GridSquare_5311584/Data/FoilHole_5366061_Data_5320469_5320471_20200209_004418_fractions_PS.mrc MotionCorr/job002/in24981-8/raw/Images-Disc1/GridSquare_5311584/Data/FoilHole_5366061_Data_5320469_5320471_20200209_004418_fractions.mrc MotionCorr/job002/in24981-8/raw/Images-Disc1/GridSquare_5311584/Data/FoilHole_5366061_Data_5320469_5320471_20200209_004418_fractions.star            1    91.289716    23.957087    67.332629

Ma question est la suivante : comment pourrais-je faire pour supprimer spécifiquement la colonne #4 (qui est en gras), correspondant au "1" en gras sur toutes mes lignes (j'en ai environ 5000) ?

Je n'ai collé ici que deux lignes en guise d'exemple.
D'avance merci et bonne journée :-)

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#2 Le 09/03/2020, à 11:13

Watael

Re : Supprimer le même texte plusieurs fois dans une colonne

salut,

quand il s'agit de colonnes, il faut demander à (G)awk.
c'est une langage très abordable, comme le shell.

ta demande est très fréquente, tu trouveras rapidement une solution en cherchant sur le net.


Connected \o/
Welcome to sHell. · eval is evil.

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#3 Le 09/03/2020, à 11:23

pingouinux

Re : Supprimer le même texte plusieurs fois dans une colonne

Bonjour,
Cette commande supprime la 4ème colonne sur toutes les lignes, et va ajouter ou supprimer des espaces à certaines lignes. Est-ce ce que tu veux ?

awk '{$4="";print}' fichier_original >fichier_modifie

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#4 Le 09/03/2020, à 11:41

kevino_linux

Re : Supprimer le même texte plusieurs fois dans une colonne

Pingouinux,

Merci pour ta réponse !
Ça a marché, et le fait que ça supprime certains espaces n'influent pas avec mon logiciel de traitement.

Par curiosité, c'est possible de ne pas ajouter/supprimer les espaces afin de garder une structure identique au fichier original ?

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#5 Le 09/03/2020, à 11:55

pingouinux

Re : Supprimer le même texte plusieurs fois dans une colonne

Par curiosité, c'est possible de ne pas ajouter/supprimer les espaces afin de garder une structure identique au fichier original ?

Oui, mais c'est plus compliqué (et plus cher…) :

sed -r 's/(([^ ]+ +){3})([^ ]+ +)/\1/' fichier_original >fichier_modifie

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